GFFDataProtocol.java

package fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.data.protocols;

import java.util.List;

import fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.EoulsanRuntime;
import fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.annotations.HadoopCompatible;
import fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.data.DataFormats;

/**
 * This class define a annotation protocol.
 * @since 1.1
 * @author Laurent Jourdren
 */
@HadoopCompatible
public class GFFDataProtocol extends StorageDataProtocol {

  public static final String PROTOCOL_NAME = "gff";

  @Override
  public String getName() {

    return PROTOCOL_NAME;
  }

  @Override
  protected List<String> getExtensions() {

    return DataFormats.ANNOTATION_GFF.getExtensions();
  }

  @Override
  protected String getBasePath() {

    return EoulsanRuntime.getSettings().getGFFStoragePath();
  }

}